ÍslenskaenEnglish

Aðilar að Skemmunni

Leit eftir:


SkýrslaHáskóli Íslands>Verkfræði- og náttúruvísindasvið>Rannsóknarverkefni>

Vinsamlegast notið þetta auðkenni þegar þið vitnið til verksins eða tengið í það: http://hdl.handle.net/1946/10805

Titill
en

Age distribution and MHC2 alfa variation in arctic charr from Lake Thingvallavatn

Leiðbeinandi
Útgáfa
Febrúar 2012
Útdrættir
  • en

    Salvelinus alpinus, also referred as Arctic charr, is a freshwater salmonid that inhabits the circumpolar region. One of the most remarkable features associated with this species is the amazing variability in different aspects concerning their morphology, life history and behavior. Although four different morphs coexist in Lake Thingvallavatn Iceland (two limnetic and two benthic), this research has dealt with two of them: Planktivorous (PL) and small benthic (SB), limnetic and benthic respectively. Nonetheless, it will be mainly focused on PL morph, especially on the characterization of MHCIIα gene in this population. MHCIIα (Major histocompatibility complex II α chain) can be used as a marker of divergence between morphs due to the high rate of polymorphism it shows. In this case, we will focus on two alleles, named as allele A and allele B. Different frequencies of these two alleles are being observed within and between both, PL and SB populations.
    Samples used in this study come from Lake Thingvallavatn, and they belong to different years (2004, 2010 and 2011). To determine the age of the fish, otoliths were scored. Pictures were taken in order to differentiate between morphs according to phenotypic features described in other studies. DNA isolation, MHCIIα region amplification by PCR and DNA sequences were obtained. I wanted to test if the genotype distribution of allele A and B in PL population were related to age. Also, I tested for a correlation between the presence of allele B on PL population and the age.
    In conclusion, this study shows that allele A frequency differs between morphs (SB and PL). However, a negative (but not significant correlation) may exist between allele B frequency and age, which may suggests selection against this allele on PL populations.

  • Bleikja (Salvelinus alpinus) er ferskvatns og sjógöngu af ætt laxfiska. Meðal bleikjunnar má finna margskonar form, sérstaklega í stærð og lögun höfuðs. Mestur fjölbreytileiki í útliti finnst í Þingvallavatni, þar sem fjögur afbrigði finnast. Um er að ræða tvö botnlæg afbrigði kuðungableikju (Planktivorous, PL) og dvergbleikju (small benthic, SB), og tvö sviflæg afbrigði, murtu (small pelagic, SP) og sílableikju (Piscivorous, PI). Hér einbeitum við okkur að því að skoða aldursdreifingu murtunar, og sérstaklega að skoða tíðni MHCIIα (Major histocompatibility complex II α chain) samsæta í stofninum. Tilgátan var sú að tíðni samsæta sé háð aldri.
    Við notuðum sýni af murtum sem safnað var 2004, 2010 og 2011. Til aldursgreiningar voru kvarnir einangraðar (með krufningum) eða fundnar í sýnabönkum Líffræðistofnunar Háskólans. Einstaklingar sem safnað var árið 2011 voru greindir til útlitsgerða, myndir af þeim voru einnig teknar til frekari greininga. DNA var einangrað úr þessum einstaklingum og hluti af MHCIIα geninu magnaður upp með PCR. Hreinsaðir bútar voru raðgreindir með Sanger aðferð og einstaklingar greindir til arfgerða (A eða B)
    Niðurstöðurnar voru misvísandi, merkið sem fannst í fiskunum frá 2010 var ekki til staðar í eldri fiskum. Því er ekki hægt að álykta að aldur hafi áhrif á tíðni B samsætunnar í murtunni í Þingvallavatni.

Birting
6.2.2012


Skrár
NafnRaðanlegtStærðHækkandiAðgangurRaðanlegtLýsingRaðanlegtSkráartegund
BS_report_Vanessa_... .pdf1,23MBOpinn Heildartexti PDF Skoða/Opna