is Íslenska en English

Lokaverkefni (Meistara)

Háskóli Íslands > Heilbrigðisvísindasvið > Meistaraprófsritgerðir - Heilbrigðisvísindasvið >

Vinsamlegast notið þetta auðkenni þegar þið vitnið til verksins eða tengið í það: https://hdl.handle.net/1946/17629

Titill: 
  • Titill er á ensku Evaluation of Lipid Composition in Several Cancer Cell Lines by Mass Spectrometry
  • Mat á lípíðsamsetningu í nokkrum krabbameinsfrumulínum með massagreini
Námsstig: 
  • Meistara
Útdráttur: 
  • Útdráttur er á ensku

    Evaluation of Lipid Composition in Several Cancer Cell Lines by Mass Spectrometry
    Lipids are very diverse and serve many purposes in cells. They serve as structural components, they store energy and can take part in signaling pathways. Defects in underlying lipid regulation can be the cause of many disorders. Fatty acid synthase (FAS) is an enzymatic system that catalyzes fatty acid synthesis. The gene for FAS is commonly overexpressed in several types of cancers and this is associated with prognosis. Those cancers have poor prognosis. Protolichesterinic acid (PA) is a secondary metabolite of the lichen Cetraria islandica. PA is structurally similar to C75 which is a FAS inhibitor and might have similar effect. Ultra performance liquid chromatography coupled with a quadrupole time of flight mass spectrometer (UPLC-QTOF) is a technique which can acquire mass spectra with high resolution, mass accuracy and sensitivity provided by parallel detection of all ions. UPLC-QTOF can be used to identify molecular lipids from complex lipidomes.
    The aims of this project were to develop methods for preparing cultured cancer cell lines for UPLC-QTOF lipid analysis. The lipidome of three breast (SK-Br3, T47D and MCF7) and one pancreas (AsPC-1) cancer cell line and were analyzed. The effect of PA on two of the cancer cell lines (SK-Br3 and T47D) was analyzed. Multivariate model was used to screen for differences.
    The four cancer cell lines showed obvious differences compared to each other. The lipid composition of SK-Br3, which overexpresses the FAS gene, was statistically significantly different from that of any from that any of the other two breast cance cell lines. Thus expression of FAS had a greater effect on differences in lipid composition than the tissue origin. The effects of PA could not be successfully analyzed because the results within PA treated cells varied more than the difference between PA treated and untreated cells.
    The methods need to be validated and samples reanalyzed with the validated method.

  • Mat á lípíðsamsetningu í nokkrum krabbameinsfrumulínum með massagreini
    Lípíð eru mjög fjölbreytt og þjóna ýmsum tilgangi í frumum. Þau eru byggingarhlutar, geyma orku og eru hluti af boðleiðum frumna. Gallar í undirliggjandi temprun á lípíðum geta verið ástæður fyrir sjúkdómum. Fitusýrusyntasi (FSS) er ensímkerfi sem hvatar fitusýru nýmyndunarferlið. Genið fyrir FSS er oftjáð í nokkrum tegundum af krabbameinum og er þessi oftjáning tengd batahorfum. Prótólichesterínsýra (PS) er annars stigs efni framleitt af fléttunni Cetraria islandica. PS hefur svipaða byggingu og C75 sem er FSS hindri og gæti haft svipuð áhrif. Vökvagreining með raðtengdum massagreini (UPLC-QTOF) er tækni með hárri upplausn, massa nákvæmni og næmni með samhliða greiningu fyrir allar jónir. Það er hægt að nota UPLC-QTOF til þess að bera kennsl á lípíð úr flóknum samsetningum lípíða í frumum.
    Markmið rannsóknarinnar var að þróa aðferðir til að undirbúa ræktaðar krabbameinsfrumur fyrir lípíð greiningu í UPLC-QTOF. Samsetning lípíða í fjórum krabbameinsfrumulínum (SK-Br3, T47D, MCF7 og AsPC-1) voru rannsökuð. Áhrif PS á tvær af frumulínunum ((SK-Br3 og T47D) var einnig rannsakað. Fjölbreytumódel var notað til skima fyrir breytileika.
    Það var greinilegur munur á milli krabbameinsfrumulínanna þegar þær voru bornar saman við hvor aðra. Lípíða samsetning, SK-Br3 sem oftjáir FSS genið sýndi tölfræðilega marktækan mun frá hinum tveimur brjóstakrabbameinsfrumulínunum. Þar af leiðandi var sýnt að FSS hafði meiri áhrif á lípíð samsetningu heldur en uppruni frumnanna. Ekki var hægt að greina áhrif PS þar sem niðurstöðurnar innan PA meðhöndlaðra frumna innihélt meiri breytileika heldur en munurinn á milli PA meðhöndlaðra og PA ómeðhöndlaðra frumna.
    Aðferðirnar þurfa að vera fullgildar og sýnin endurmæld með þeim.

Samþykkt: 
  • 30.4.2014
URI: 
  • http://hdl.handle.net/1946/17629


Skrár
Skráarnafn Stærð AðgangurLýsingSkráartegund 
MSritgerd_lyfjafraedi (Andri Hallgrímsson) loka.pdf1.79 MBLokaður til...01.04.2030HeildartextiPDF