en English is Íslenska

Article Agricultural University of Iceland > Rafræn tímarit > Búvísindi = Icelandic agricultural sciences >

Please use this identifier to cite or link to this item: http://hdl.handle.net/1946/19911

Title: 
  • Proteome analysis of abundant proteins in early Atlantic cod (Gadus morhua) larvae
  • Title is in Icelandic Greining á helstu próteinum í próteinmengi þorsklirfa á frumfóðrunarstigi
Keywords: 
Published: 
  • 2011
Abstract: 
  • The production of good quality larvae is a challenge in marine fish hatcheries. In this study, the proteome profile of Atlantic cod (Gadus morhua) was analyzed using 2-DE, MALDI TOF MS and LC-MS/MS in order to determine its protein composition. Out of 109 abundant spots analyzed with MS 77 proteins were identified. The identified proteins were classified into 5 groups: structural proteins (56%), cytosolic proteins (29%), mitochondrial proteins (7%), secreted and extracellular proteins (7%) and nuclear proteins (1%). This study is the first step in a future construction of an Atlantic cod protein database that will be a valuable resource for molecular analysis of marine fish larval development.

  • Abstract is in Icelandic

    Afkoma og gæði er einn megin flöskuhálsinn við framleiðslu sjávarfiska í eldi. Í þessari rannsókn var próteinmengi þorsklirfa aðgreint á tvívíðum rafdráttargeljum. Um 450 próteindeplar, með mólmassa á bilinu 6-100 kDa og jafnhleðslupunkt (pI) á bilinu pH 4-7, voru greindir. Rúmlega 100 próteindeplar voru skornir út úr rafdráttargeljum til nánari skoðunar. Um 70% þeirra voru kennigreindir með massagreiningum (MALDI-TOF MS og LC-MS/MS) og upplýsingum úr prótein gagnabönkum (Swiss-Prot og NCBInr). Stór hluti próteindeplanna voru úr vöðva og frumugrind eins og búast mátti við þar sem greiningin var gerð á heilum lirfum. Niðurstöður rannsóknarinnar eru fyrsta skrefið í uppbyggingu á gagnabanka fyrir próteinmengi þorsklirfa sem mun þjóna mikilvægum tilgangi í rannsóknum á lirfum sjávarfiska í framtíðinni.

Citation: 
  • Icelandic agricultural sciences 24, 23-31
ISSN: 
  • 1670-567x
Related Link: 
  • http://www.ias.is/landbunadur/wgsamvef.nsf/Attachment/Holmfridur%20Sveinsdottir%20et%20al%202011%20IAS/$file/Holmfridur%20Sveinsdottir%20et%20al%202011%20IAS.pdf
Accepted: 
  • Oct 14, 2014
URI: 
  • http://hdl.handle.net/1946/19911


Files in This Item:
Filename Size VisibilityDescriptionFormat 
Holmfridur Sveinsdottir et al 2011 IAS.pdf219.03 kBOpenHeildartextiPDFView/Open