is Íslenska en English

Lokaverkefni (Meistara)

Háskólinn í Reykjavík > Tæknisvið / School of Technology > Med/MSc Tækni- og verkfræðideild (-2019) / School of Science and Engineering >

Vinsamlegast notið þetta auðkenni þegar þið vitnið til verksins eða tengið í það: http://hdl.handle.net/1946/22317

Titill: 
  • Titill er á ensku Classifying Drug-Induced Epileptic Seizures in Zebrafish Larvae
  • Greining lyfja-framkallaðra flogakasta í sebrafiskalirfum
Námsstig: 
  • Meistara
Útdráttur: 
  • Útdráttur er á ensku

    Zebrafish (Danio rerio) is one of the model organisms used for epilepsy research and have been found to have enormous potential for modelling acute seizures and genetic epilepsies. In this project, a mathematical classification model was created with the aim of correctly classifying zebrafish larvae having an (PTZ induced) epileptic seizure. The model also computes biomedical parameters describing behavioural attributes of the larvae. Several data mining approaches were implemented for the data, of which best results were obtained for support vector machine using second-degree polynomial kernel function. Results indicate 91.33% classification accuracy on training data and when run on the new testing datasets similar classification accuracy was obtained, 90.96%. A future application of this model is to aid in the development of new medication to treat epilepsy.

  • Sebrafiskar (Danio rerio) eru með einfaldari dýralíkönum sem notuð eru við rannsóknir á flogaveiki. Sýnt hefur verið fram á að sebrafiskar geti orðið gríðarlega nytsamir sem dýralíkan fyrir bráðaflog og mismunandi erfðafræðilegar tegundir flogaveiki. Í þessu verkefni var búið til stærðfræðilegt flokkunarlíkan með því markmiði að flokka rétt sebrafiskalirfur sem eru með (PTZ framkölluð) flog. Líkanið reiknar einnig lífbreytur sem lýsa hegðunareiginleikum lirfa. Nokkrum gagnanámsaðferðum var beitt en support vector machine með annarar gráðu margliðu kernel reyndist henta best. Niðurstöður benda til 91.33% flokkunarnákvæmni. Þegar líkanið var prófað á ný gagnasett fengust svipaðar niðurstöður eða 90.96% rétt flokkaðar lirfur. Líkanið verður hægt að nota til þess að þróa ný lyf við flogaveiki.

Samþykkt: 
  • 1.7.2015
URI: 
  • http://hdl.handle.net/1946/22317


Skrár
Skráarnafn Stærð AðgangurLýsingSkráartegund 
Lilja Nielsdottir - Classifying Drug-Induced Epileptic Seizures in Zebrafish Larvae.pdf1.55 MBOpinnHeildartextiPDFSkoða/Opna