Heildæn metabólísk greining á þekjuvefs og mesenchymal frumulínum í frumurækt

Abstract

Epithelial-to-mesenchymal transition (EMT) er náttúrulegt ferli sem gerist í þroskun, vexti og græðslu sára. Tengsl EMT við meinvörp og krabbamein hefur lengi legið undir grun. EMT hefur af þeim orsökum verið rannsakað gífurlega mikið á seinastliðnum áratugum með það markmið að leiðarljósi að auðkenna ný lyfjamörk sem geta heft framgang krabbameins. Í þessu verkefni voru breytingar í efnainnihaldi brjóstaþekjuvefs frumulínunnar D492 og mesenchymal hliðstæðu hennar, frumulínunnar D492M, kannaðar. D492 frumulínur er hægt að nota til þess að rannsaka EMT í frumurækt.Efnainnihald frumnanna var rannsakað með lífupplýsinga aðferðafræði sem kallast heildræn metabólísk greining. Greiningin var framkvæmd á gögnum sem höfðu fengist við að efnagreina smáar lífrænar sameindir í D492 og D492M með massagreini tengdum vökvaskilju. Metabólískar greingar eru ein grunnstoðin í efnagreiningu innan lífefnafræði. Yfir 200 massar sýndu breytileika á milli D492 og D492M, þar af voru 17 mismunandi metabólítar auðkenndir, sumir í fleiri en einu sýni. Þar ber helst að nefna breytingar í glútaþíoni og forvera sykrunga. Niðurstöður staðfesta fyrri niðurstöður sem hafa bent til mismuns í nýmyndun yfirborðssykrunga þessara frumna sem og mismun í glútaþíon efnabúskap.

Epithelial-to-mesenchymal transition (EMT) is a natural process that happens in development, growth and wound healing. The relationship between EMT and both metastasis and cancer has been long suspected so EMT has been heavily researched in the last decades with the objective of finding new therapeutic targets that can limit the progression of cancer. In this project, the changes in the metabolome between the breast epithelial cell line D492 and its mesenchymal counterpart, the cell line D492M, were researched. The D492 cell line can be used to investigate EMT in cell culture.The metabolome of the cells was researched using a bioinformatics method called untargeted metabolomics. Analysis was done on data that was gathered by liquid chromatography-mass spectrometry runs on the metabolome of D492 and D492M. Metabolomics has become one of the bases for chemical analysis in biochemistry. Over 200 masses were shown to differ between D492 and D492M, with 17 different metabolites identified, some in multiple samples. Most notable are the differences between glutathione and sugar precursors. Results confirm earlier findings that suggest a difference in cell surface sugar synthesis and in glutathione levels between these cell lines.