is Íslenska en English

Lokaverkefni (Bakkalár)

Háskóli Íslands > Verkfræði- og náttúruvísindasvið > B.S. verkefni - Verkfræði- og náttúruvísindasvið >

Vinsamlegast notið þetta auðkenni þegar þið vitnið til verksins eða tengið í það: http://hdl.handle.net/1946/35796

Titill: 
  • Titill er á ensku Transcriptomic profiling of BRCA2 999del5 heterozygous cell lines
  • Breytt genatjáning í frumum arfblendnum um BRCA2 999del5 stökkbreytingu
Námsstig: 
  • Bakkalár
Útdráttur: 
  • Útdráttur er á ensku

    Breast cancer is the world's most common cancer diagnosed among women and it has been demonstrated that mutations in genes with roles in DNA repair pathways can vastly increase susceptibility for breast tumorigenesis. BRCA1 and BRCA2 are tumor suppressor genes which have roles in Homologous recombination, a DNA repair pathway that repairs double strand chromosomal breaks, and these genes are found mutated in multiple breast cancer cases. Approximately 7-8% of female breast cancer cases in Iceland are derived from a founder mutation in the BRCA2 gene (BRCA2 999del5), which is a 5bp deletion that leads to the formation of a stop codon. The truncated protein, encoded by the mutated BRCA2 999del5 gene, is extremely unstable and constantly degraded in cells which leads to loss of function. It has been demonstrated that genes that possess similar functions in DNA repair pathways, are upregulated in some cases where there is a complete loss of BRCA2 function. This indicates that these cells rely more heavily on alternative DNA repair pathways which minimize the hazardous effects that accompany the loss of BRCA2 function. However, this has only been examined in homozygous cases; that is when BRCA2 mutations are present in both alleles resulting in a complete loss of gene function.
    The objective of this study was to examine whether genes that possess similar functions as BRCA2 in DNA repair pathways are upregulated in cell lines that are heterozygous for the BRCA2 999del5 mutation. RNA sequencing data was analyzed in order to identify possible target genes and the results revealed multiple genes that are significantly overexpressed in the BRCA2 999del5 cell lines. If any of these particular genes are in fact compensating for reduced BRCA2 function, it is possible to examine if any of them is synthetic lethal with BRCA2, which could lead to novel drug targets for cancer treatments.

  • Brjóstakrabbamein er algengasta krabbamein kvenna í heiminum. Sýnt hefur verið fram á að arfgengir gallar í DNA viðgerðargenum geta aukið hættu á brjóstakrabbameini verulega. BRCA1 og BRCA2 eru æxlisbæligen sem hafa meðal annars hlutverk í endurröðunarviðgerðarferli sem verkar á DNA með tvíþátta rof og stökkbrigði þessara tilteknu gena hafa fundist í fjölmörgum brjóstakrabbameinum. Hægt er að rekja um 7-8% brjóstakrabbameina sem greinast á Íslandi til ákveðinnar stökkbreytingar í BRCA2 geninu (BRCA2 999del5) en stökkbreytingin er 5 bp úrfelling sem leiðir til myndunar á stopp tákna. Próteinafurð stökkbrigðisins er þar með óstöðug og er brotin niður sem leiðir til þess að öll virknin tapast. Sýnt hefur verið fram á að í sumum tilfellum eru ákveðin gen sem hafa skyld hlutverk í DNA viðgerðarferlum tjáð í auknu mæli í einstaklingum þar sem virkni BRCA2 gensins hefur tapast. Þetta leiðir til þess að þau skaðlegu áhrif sem tap á virkni BRCA2 gensins hefur í för með sér eru töluvert minni þar sem að varaferlar taka þá að einhverju leiti við. Þetta hefur þó aðeins verið skoðað í arfhreinum tilfellum, þ.e. þar sem öll BRCA2 virkni hefur tapast.
    Markmið þessara verkefnis var að rannsaka hvort viðgerðargen sem hafa skyld hlutverk og BRCA2 séu yfirtjáð í arfblendnum frumulínum um BRCA2 999del5 stökkbreytinguna. Með því að rannsaka RNA raðgreiningargögn bárum við kennsl á fjölmörg gen sem eru marktækt yfirtjáð í BRCA2 999del5 arfblendnum frumum og gætu verið að bæta upp fyrir minnkaða virkni BRCA2. Ef einhver af þessum tilteknu genum eru að bæta upp fyrir tap á virkni BRCA2 gensins er hægt að athuga hvort það ríki banvænt samband (e. synthetic lethality) milli BRCA2 gensins og einhverra þeirra sem gæti leitt til nýrrar lyfjamarka og meðferðarúrræða.

Samþykkt: 
  • 2.6.2020
URI: 
  • http://hdl.handle.net/1946/35796


Skrár
Skráarnafn Stærð AðgangurLýsingSkráartegund 
BS_ritgerd_loka.pdf1.27 MBLokaður til...30.12.2023HeildartextiPDF
Skemman_yfirlysing.pdf320.7 kBLokaðurYfirlýsingPDF