en English is Íslenska

Thesis (Bachelor's)

University of Iceland > Verkfræði- og náttúruvísindasvið > B.S. verkefni - Verkfræði- og náttúruvísindasvið >

Please use this identifier to cite or link to this item: http://hdl.handle.net/1946/41378

Title: 
  • Construction of a Rhodothermus marinus expression vector for Sulfolobus Tip49
Degree: 
  • Bachelor's
Abstract: 
  • The ATPases Pontin (RUVBL1) and Reptin (RUVBL2) are paralogous proteins of the AAA+ protein family. The proteins are suggested to partake in chaperone-like activities and aid in the assembly and stability of several essential protein complexes. Pontin and Reptin are highly conserverved in eukaryotes and share a common ancestor with the archaeal tip49, whose functions are unknown. Our lab previously used E. coli to express the tip49 gene from S. acidocaldarius, however, this yielded mostly insoluble protein which most likely was not correctly folded. As S. acidocaldarius is a thermophilic organism, a thermophilic host could be more appropriate for the expression to ensure the proper folding and function of the protein. Recently, a protein expression system was developed for the thermophilic bacterium R. marinus. In this study attempts were made to clone the tip49 gene from S. acidocaldarius into a R. marinus¬-E. coli shuttle vector with. Furthermore, to be able to study Tip49 directly in the original organism in the future we tried to culture several Sulfolobus strains. However, none of those attempts was successful.

  • Abstract is in Icelandic

    ATPasarnir Pontin (RUVBL1) og Reptin (RUVBL2) eru hliðstæð prótein í AAA+ prótein fjölskyldunni. Próteinin eru talin hafa siðvörðsluprótein-líka virkni og aðstoða við samsetningu og stöðugleika lífsnauðsynlegra próteinflóka. Pontin og Reptin eru mjög vel varðveitt í heilkjörnungum og deila sameiginlegum forföður með fornbakteríugeninu tip49, en virkni þess er óþekkt. Á rannsóknarstofunni okkar hefur bakterían E. coli áður verið notuð til að tjá Tip49 próteinið úr S. acidocaldarius með það að markmiði að hreinsa virkt prótein til lífefnafræðilegra mælinga. Prótein einangrað á þennan hátt reyndist hins vegar að miklu leyti óleysanlegt og hafði líkleg ekki rétta þrívíddarbyggingu. Þar sem S. acidocaldarius er hitakær lífvera þá á það líklega betur við að tjá genið í annarri hitakærri lífveru til þess að auka líkurnar á réttri svipmótun og virkni próteinsins. Nýlega var þróað kerfi til þess að erfðabreyta hitakæru bakteríunnu R. marinus. Í þessu verkefni var gerð tilraun til þess að klóna tip49 genið úr S. acidocaldarius í R. marinus¬-E. coli skutluferju. Til þess að síðar væri hægt að rannsaka Tip49 beint í upprunalegu lífverunni, var reynt að rækta nokkra Sulfolobus stofna, en þær tilraunir báru ekki árangur.

Accepted: 
  • May 30, 2022
URI: 
  • http://hdl.handle.net/1946/41378


Files in This Item:
Filename Size VisibilityDescriptionFormat 
Jon Baldvin Helgason Moller BS ritgerd_28MAY22-1.pdf898.74 kBOpenComplete TextPDFView/Open
Yfirlýsing um meðferð.pdf52.61 kBLockedDeclaration of AccessPDF